繼520埔里全鎮大消毒後，在全台本土疫情尚未趨緩，加上南投縣陸續有確診案例傳出之際，埔里鎮截至今日也有五例確診案例，埔里鎮長廖志城商請合成里大坪頂的農民，在6月3日上午8點，再次出動自走式噴霧車，在各里里長帶領下進行各區消毒作業。

此時正值農忙時期，但在合成里陳信順里長及合成社區發展協會蔡明煌理事長的號召之下，所有農民仍表達樂意幫忙齊心抗疫的意願，除了能緩解埔里鎮清潔隊僅有兩台消毒車，避免作業耗時外，更因車身輕巧能深入大型消毒車無法抵達的巷弄。

而此次全鎮大消毒除有大坪頂的農民相挺外，另外昌林國際貿易股份有限公司丁建文董事長捐贈20桶20公升，濃度26%的次氯酸納（漂白水），還有新光華造紙股份有限公司游泰成董事長也捐贈一公噸的漂白水，供鎮上消毒使用。

為了因應部分里別範圍較廣，消毒車有再次補充消毒液的需求，為了降低自走式噴霧車返回埔里清潔隊裝載消毒液的時間，台灣自來水公司埔里營運所更配合提供取水服務，在鎮民、私人企業及公部門共同努力下，齊心守護家鄉安全。

鎮長廖志城也建議鎮民居家環境消毒可用含次氯酸鈉的漂白水以1：100的清水稀釋後使用，而埔里鎮公所外也免費提供有次氯酸水，目前採24小時全天候開放領取，每位民眾限領2公升，請自備不透光容器取回後放置陰涼處，使用時不稀釋直接進行居家環境消毒，但因有效期較短請儘速使用完畢；但若要清潔手部，還是應以肥皂洗手，不方便洗手時改使用75％的酒精產品。

自全國本土疫情升溫，升級為三級警戒後，鎮內多處公共空間如公園等皆已拉起禁止進入的封鎖線，但陸續還是有民眾反應發現有群聚現象，鎮長廖志城也要再次呼籲鄉親，在本土疫情險峻的狀況下，為了保護自己及家人的安全，請大家共體時艱，務必遵守防疫相關規定：出門全程戴好口罩、香皂勤洗手、非必要不出門、保持社交距離且避免群聚，也要拜託鄉親不要為了搶購物資一窩蜂擠進大賣場，反而提高群聚感染的風險，一起努力阻斷傳播鏈，避免疫情持續擴散；如未依規定佩戴口罩者或違反規定者，將不再勸導依傳染病防治法第70條第1項第3款規定，裁罰3千元以上1萬5千元以下罰鍰。